Klášter byl založen kolem roku 1209 Lvem z Klobouk. Během husitských válek byl ale poškozen a sloužil jako vojenská nemocnice. Dnešní mariánský kostel nechal v letech 1661-1668 vystavět Pavel Weinbergee podle projektu Giovanniho Pietra Tencally. Kaple Panny Marie Čenstochové byla přistavěna až téměř po sto letech (1753-1755) podle návrhu Mořice Grimma. V 70. letech 18. století byly v kostele nainstalovány oltáře a interiér byl upraven do nynější podoby. Kostel podnes patří k nejkrásnějším brněnským barokním stavbám.